杨康的儿子杨过（古天乐饰）自小被郭靖收养，郭靖希望他学好，于是送到了桃花岛跟黄药诗学习。杨过在桃花岛上整日被郭芙和大、小武欺负，一气之下独自出走了。杨过被古墓派的小龙女（李若彤饰）收留，认她作姑姑，生活在活死人墓里跟小龙女学习武功，日久天长，两人渐渐互生情愫，决定今生今世结成夫妻，永远生活在古墓。可惜机缘巧合下，他们最终要走出活死人墓，去经历一番江湖恩怨，两人最后能否有情人终成眷属？
本片讲述天祈元年，天祈帝登基，为寻找《黄帝内经》失传的卷宗里所记载的长生不老药“无果”，特成立了一个同时精通医术与暗杀技巧的组织——探丸郎。探丸郎李、宋两人在寻觅多年后，终于得到“无果”，但打开后发现竟是两颗药，一颗是致死的毒药，一颗是长生不老药。天祈帝病危，不得已取其一而服下，却误服毒药身亡。朝廷遂将李、宋两家满门屠戮。十五年后，李家唯一幸存下来的李时和三叔在城中开了一个不起眼的医馆聊生。李时生性散漫，是城中出了名的小流氓。三叔虽然表面正人君子，却也是个流连风月场所的色鬼。与此同时，宋家幸存下来的兄妹宋
