《独自生活的小学生》讲述了这样一个故事：时值1980年代，江之岛的小学四年级的女生铃音凛（鈴音リン）父母双亡，她独自经营着食堂生活下去。
“不会捡到‘这样的东西’……。”虽然变身成魔法少女，却对于变身后的装束泳装无论如何都没法习惯的柚华。究竟柚华接受魔法少女的那一天会不会到来呢！？
故事从2001年开始，回溯到18年前。1978年，巴莱奥罗格斯作战大败，次年波兰陷落。由于这两个原因，东德在1983年成为欧洲防卫的最前线，炽烈的战火开始蔓延。由于BETA集群的大规模攻势，东德部队的防线陷入了困境。东德的头号战术机甲部队，第666战术机甲中队“Schwarzes marken”受命，须以区区8骑的战力去消灭布阵在后方的光线级BETA，以逆转战局。面对数目庞大的BETA，暴雪不断的恶劣天气，以及国家权力施加在自己的头上的重压，被迫在严酷的条件下进行作战，他们的命运将走向何方？
平凡的少女叶波柚香，某天在回家的路上看见了一只神秘生物「米咚」，并被告知自己具有魔法少女的素质。柚香心中虽然有些犹豫，但还是决定接受腕轮，成为一名魔法少女。没想到变身的服装居然是泳装！？米咚更是不时对她作出性骚扰行为的欠扁生物……一场没有敌人的奇妙生活就此展开！
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