以成为飞行医生为目标的四名医师，作为实习生一同来到了翔阳大学附属北部医院急救中心赴任。当他们在前辈的带领下在中心内四处查看时，正好有患者被直升机送来，他们开始了对患者的急救。表现出了自己的技术和知识量的蓝泽与白石参加了手术。绯山负责联络73岁患者的家属，藤川则负责对年轻的少女·糖尿病患者美树进行检查。飞行医生黑田负责指导实习生，下午白石则要登上直升机。收到了需要直升机的请求，白石按照预定计划赶往现场。但由于过于紧张，没能做好处理，让她十分消沉。在中心，正要开始对送来的患者进行处理，然而白石还是无法从现场的
1993年，以“林氏盖饭”做招牌菜的饭店里有着幸福的一家，这晚三个孩子偷偷出去看流星躲过了灭门的惨案，当他们回来时发现父母已被刺杀身亡。到了2008年，大哥有明功一（二宫和也KazunariNinomiya饰）在一家料理店打工，却不肯为客人再做一次家传的“林氏盖饭”；二弟泰辅（锦户亮RyoNishikido饰）和妹妹静奈（户田惠梨香ErikaToda饰）在东京共租一个房间。三人的生活都有点吊儿郎当，是当年惨案以及相依为命成长的童年的后遗症。眼看到11月就会过了案件诉讼期了，他们三兄妹立誓一定要把当年杀害父
掌控日本国家未来的御前会议上，众要员商议着以猎杀SPEC持有者为目标的“SIMPLE PLAN”，神秘的法蒂玛第三预言亦被提及。数天后，暗中执行猎杀计划的政府成员突然于游艇上全员木乃伊化死亡。案件交由未详系的当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）负责。调查途中两人接到志村美玲（福田沙纪 饰）的求救电话，赶赴救援时与濑文的前同僚兼前恋人青池里子（栗山千明 饰）不期而遇。当麻将美玲带回未详系，原本已经死去的阳太/一十一（神木隆之介 饰）竟从容现身于她们面前。竭力压制着蠢蠢欲动的左手，当麻无力的目睹
经过与一十一（神木隆之介 饰）的恶战，濑文焚流（加濑亮 饰）身受重伤，命几不保。在此期间，青池里子（栗山千明 饰）随女儿小润（森山树 饰）悄然离开医院；而各国政要的一次关于简单计划的秘密会议上，自称卑弥呼的日本代表抹杀所有人，他代表SPEC持有者正式向普通人类宣战。世态险恶的当下，濑文急急出院，和当麻纱绫（户田惠梨香 饰）一同调查青池母女的行踪。而野野村组长（龙雷太 饰）则独自行动，查找简单计划病毒疫苗的下落。新的SPEC持有者交替登场，残酷的杀戮却从未停止。关于前人类的秘密昭然若揭，惨烈浩大的人种战争即
前人类和普通人类的人种战争已经到了白热化的阶段，野野村组长去世后，吉川（北村一辉 饰）、当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）等人聚在未详总部，苦苦思索J教授的真身。谁知就在当麻刚刚弄清真相的同时，警察医院内的成年和儿童SPEC持有者遭到残忍屠戮。愤怒的当麻无法抑制体内被封印的SPEC，她狂乱暴走，继而现身御前会议。在犹大、世界（向井理 饰）、润（大岛优子 饰）的见证下，法蒂玛第三预言实现了。恐怖刺眼的蘑菇云在上空升起，成千上万的八尺乌遮天蔽日，被欲望所支配与荼毒的世界迎来了毁灭时刻。 在
