前作《AKite》的故事结束几年之后，宇宙空间站中，各位队员边吃着宇宙食品边抱怨食品的难吃，宇航员野口折外也是其中的一员。过几天是他女儿野口百合花的生日，他托付营养员土井光一将礼物寄送给女儿。地球上，警员我贺伦追捕连续杀人犯追音香衣，后者被迫躲入女厕并劫持了一名人质。正当我贺伦对胶着的情况左右为难之际，一位少女从暗处出现，开枪击毙了追音香衣。谁也不知道，这两件看似无关的事件，有紧密的关联，宿命的轮盘开始转动。
为了继承父亲帝野熊五郎（小山力也配音）的遗嘱，高中生帝野将悟（樱井孝宏配音）进入了贵族学校深流院学园学习如何成为一个合格社长，不仅如此，在接下来的两年中，将悟还必须在学园中找到可以托付一生的结婚伴侣。这可难倒了个性普通的将悟，不过，世上无难事，将悟愉快的高中生活就要开始了。在生日的当天，将悟接到了一个自称是“妹妹”的女孩打来的电话，然而这位妹妹究竟是谁，将悟毫无头绪。在学园中，将悟结识了许多可爱的女孩子，有学级委员鹤真心乃枝（石原夏织配音），沉默害羞的神凪雅（佐仓绫音配音），高智商少女嵯峨良芽衣（日高里菜
日本伊豆群岛中有一个名为六轩岛的岛屿，该岛是富豪右代宫家的私人领土，有关于该岛的流言从未停息。一条游轮正向岛屿驶来，船上乘坐的均为右代宫家族的族人，他们来到六轩岛，是为了参加一年一度的家族会议。岛主右代宫金藏（麦人配音）因沉迷于黑魔法研究和酗酒身体早已不堪重负，族人们此行正是为了讨论他巨额遗产的分割问题而来。表面上和气的亲戚们，每个人的心中都打着有利于自己的算盘。作为次男家的独子，战人（小野大辅配音）抬头望去，海猫在天空中盘旋，暴风雨就快要来了。岛上发生了猎奇杀人事件，自私的族人们接二连三的以惨绝人寰的姿
经验丰富稳重可靠的贤狼赫萝（小清水亚美配音）遇见了孤身一人独自旅行的商人罗伦斯（福山润配音），两人结为了旅伴，携手踏上充满了未知的旅程。某日，他们从教会都市出发，前往赫萝的故乡约伊兹。途中，两人来到了正在举行着盛大祭奠的城市库梅尔森，一位名叫阿马堤（千叶纱子配音）出现在了他们的身边。阿马堤是一位善良热心的鱼商人，他被赫萝的活力与自信深深吸引，情不自禁坠入了情网。而罗伦斯的内心里对于赫萝也产生了微妙的感情，看着阿马堤对赫萝的热烈攻势，罗伦斯的心中不知是什么滋味，而他同赫萝也似乎陷入了一个误会之中。
時為亂世。在帝國戰亂時期，有著一群在亂世裡領導民眾的七星英雄「北辰天君」。其中被稱為「二天神尊」的破軍與貪狼有著相互激烈對峙的宿命存在，原本被推斷在同一時代不會同時出現，但命運的齒輪卻出現了異變。在賢帝國全體艱難地苟延殘喘的現今，有著毫不相容、弓箭相向的「二天神尊」破軍・岱燈獅麗與貪狼・慶狼的存在。各自為了各個國家與自身國家的和平而貫徹自身的正義且互不相容。在宿命的名義下，上天到底會選擇哪一邊的正義呢──。
2071年的万圣节前夕，火星上的大城市突然发生了令人惊叹的犯罪。高速公路上一辆油罐车爆炸了。事故发生现场的人们因不明原因病倒，死伤人数超过400人。这样大规模的杀人事件，似乎是不明来源的生物武器所为。为此，火星政府发布了3亿圆的赏金悬赏恐怖分子。目击事件的faye单独行动妄图独占赏金，艾德使用黑客技术找到线索，与Bebop号上的大家一起行动。四人一狗组合再次出动，但他们不知道，这3亿元的代价，是对抗前所未有的强大犯罪者。
三谷裳千绪（太空直美配音）是就读于鲛岛学园的平凡高中一年级女生，无论是样貌、性格或是成绩，都只能用平平无奇来形容，然而千绪本人非常享受这种低调闲散的状态。在家里，千绪是个标准的游戏宅，总是沉迷于各种各样的欧美角色扮演游戏之中。千绪的家离学校并不远，所以每天千绪都依靠走路上学，奇怪的是，每一天，在千绪的上学路上，似乎有什么在冥冥之中阻挠着她抵达学校，状况百出，麻烦不断，而千绪兵来将挡水来土掩，最终总是能够化解危机。和千绪一起上学的，还有和千绪互相嫌弃的青梅竹马野野村真奈菜（小见川千明配音）和田径部王牌细川雪
动画第2季《Fate/kaleidliner》（魔法少女伊莉雅2wei）将是漫画版《Fate/kaleidliner魔法少女伊莉雅2wei》的内容，紧接第一季，继续讲述自回收卡片作战过后数周以来，伊莉雅重返过去的日常生活。然而，既然已经当过魔法少女，麻烦就会如影随形！这次她竟然是被无预警出现的另一个自己追杀!?魔法恐怖(？)故事。第2幕堂堂开演！
