爱丽丝（米拉•乔沃维奇 Milla Jovovich 饰）重回在东京，向安布雷拉公司复仇。后者潜藏在地球的底部，威斯克（肖恩•罗伯茨 Shawn Roberts 饰）执行着自以为是的安全技术标准。爱丽丝闯入了禁区，直捣黄龙。而威斯克竟然不惜毁灭城市做困兽斗。最终，当他驾驶着直升机逃离时，却被爱丽丝胁迫，情急之下，他向爱丽丝身上注入了具有对T细胞的免疫病毒，令她丧失了超能力，只能驾机飞翔荒无人烟的阿拉斯加。地球上已经177天没有生命迹象。然而，爱丽丝却意外发现了克莱尔（艾丽•拉特 Ali Larter 饰）
1968年 乔治的飞船误入两千年后的地球并失事，在善良的猿族 夫妇兹瑞和考尼斯的帮助下，他逃出了猿族的监牢，但猿族首领佐斯博士并没打算放过他》（Beneath the Planet of the Apes） 1970年 前来搜寻乔治的飞船再次失事在星球上新加入的战友和乔治联手去阻止猿族对人类的杀戮....
