月黑风高的树林中,秦芝艾正在被迫进行一场冥婚,未婚夫孟宗竹得知真相不顾一切追踪而来。突然,夜空中一道白光闪过,一切都静止了……原来赫巴星人赫巴女来到了地球需要完成她的任务,无奈艾草石能量耗尽,只能附到秦芝艾的身上,就这样赫巴女秦芝艾深入皇城与一众奸臣斗智斗勇,与孟宗竹里应外合救出秦氏夫妇,却发现了皇城内太子另一个更大的阴谋……
中医世家艾真堂堂主夫妇双双遇难,留下女儿秦芝艾继续行医救人,意外救治了不死傀孟宗竹。孟宗竹身怀秘密来到医馆调查云诗夫妇死因,利用不死傀身份控制小医仙成为她的主人。从此二人一起行走江湖悬壶济世,还卷入了一系列朝堂纷争。最终云诗夫妇死因真相大白,秦芝艾也凭借高超的医术成功救治了皇帝,成为御赐“小医仙儿”。