在一个自然和现代相结合的沿海城市，活泼、可爱、古灵精怪的小女孩晓晓和忙碌又热爱生活的爸爸，温柔美丽贤淑的妈妈和可爱调皮的宠物猫毛毛先生生活在一起。
两个小学生小安和珊珊在学习郭明义后，学会了正确处理日常学习生活中碰到的问题。
贝贝等人前往探索人类世界，来到了因为破坏环境而遭受蚜虫攻击的古树镇。镇子被魔法药剂缩小，人类也被缩小。最终，大家帮助镇子恢复了原状，而人类也领悟到保护环境的重要性。
经历了许多风波的香菇镇，终于迎来了一段安宁祥和的时光。纳诺、淇淇、维加三人驾着崭新的飞船，准备离开香菇镇，去探索浩瀚未知的宇宙。在宇宙中漫无目的飞行的飞船，在纳诺、淇淇、维加的商讨下，决定飞去工具星系，寻找淇淇的爸爸妈妈。但在这之前，他们遇上了黑洞。黑洞挡住了纳诺一行的飞行，声称要将他们吞掉，像吞掉胡萝卜岛那样。纳诺一行勇敢前行，与黑洞斗智斗勇，终于摆脱了黑洞的阻挠。纳诺、淇淇、维加经历了许多困难，终于找到了淇淇爸爸，并来到了秘密基地。在这里，淇淇也见到了自己的妈妈。大家齐心协力，终于将钢铁巨钉打败了，钢
描写了以马鸣加为主角的低年级小学生的校园生活和趣事，例如初上学的新奇，趴在地上学小猫喝水，怎样和同桌女孩从冤家变成朋友，既盼望假期又期盼开学的矛盾等，诠释了孩子们平常而有趣、单纯而快乐的真实生活，以及成长所必须经历的种种苦恼。
故事接第一季剧情，围绕主人公鸿烈、黎祁、鸡鸣、狗跳一行四人进入淮南子世界寻找爷爷的主线展开。在神奇的淮南子世界中，主人公见证了治水的大禹用仁爱之心平息部落间的纷争，帮助努力奋进的赛车手尹需实现梦想，与嫦娥、后羿并肩战斗消灭危害人间的火鸟，和幻化成人形的影子成为朋友，表演俳优戏、学做锻钩、看到沧海桑田的变化……一段段传奇经历使鸿烈和他的朋友们懂得了人与自然、人与人和谐相处的真谛。
勇敢的男孩小宏接触到魔幻元珠，成为了充满正义感的元珠能力者，他和来自不同时空的少年能力者以及幕后技术智囊们一起，带领盟卡伙伴守护城市和人们。新一季里，自私的外星反派为了复苏自己时空的黑洞行星，不顾大地的安危夺走大量魔幻元珠，引发各种灾害。小宏团结伙伴们一起挺身而出拯救危机，在此期间他们了解到黑洞行星的过去，也用真诚让反派阵营的两位少年能力者逐渐醒悟而成为正义的伙伴，让大地和星际时空重现和平与安宁。
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