Marty Weaver(伦尼·维尼托 Lenny Venito 饰)一心想让妻子Debbie(杰米·格尔兹 Jami Gertz 饰)和孩子们过上幸福富足的生活。他花一重金在新泽西的私人社区买了
2044年的纽约,大反派朗格勾结外星恶势力试图毁灭地球,大量外星人通过神秘传送门入侵,将城市化为灰烬。忍者神龟们虽负隅顽抗仍不敌敌人攻势,死伤惨重。怀抱着忍者最强武器——希望,忍者神龟们决定回到过去时空,找到开启传送门的钥匙,阻止朗格,恢复世界和平。里奥纳多的弟子凯西肩负起这一使命,他在过去时空与女记者艾普利尔·奥尼尔成功接头,并和忍者神龟们汇合,开启了拯救世界的行动。“我们的未来,我们自己做主”忍者神龟们向朗格发起了终极挑战。