小新一家还有风间,妮妮,正男,阿呆一起报名动感超人周年纪念南海之旅,就在动感超人电影的船上首映会上,突然出现了一群粗暴的猴子将大人们都掳走了。春日部防卫队为了救出大人们而出动,小新一行人冒险渡海到南海上的一座荒岛希望可以查出发生了什么事,但本应在船上小葵和小白竟突然出现,小新还发现另一辆古怪的船......
某日,小新(矢岛晶子配音)、小葵和美伢(楢桥美纪配音)被一群神秘人物绑架,醒来之后发现身处一间神秘的基地之内,原来,这里是名为“温泉G组”的秘密组织,意在保护对于日本来说十分珍贵的温泉。然而,横空出世的污垢达人博士(家弓家正配音)企图利用“地球温泉计划”将温泉G组彻底击垮。唯一能够阻止污垢达人博士的阴谋的,就只有仅存在于传说之中的“黄金之魂温泉”,而组员们经过调查,发现该温泉正好处于小新他们家地下。小新一家人决定帮助温泉G组的同胞们找到黄金之魂温泉,却遭到了污垢达人博士的袭击,并且最终沦为俘虏遭受了酷刑。
大件事!小新一家變成全國通輯犯!在少年警訊的「野原家成魔之路特輯」中透露,小新一家正與邪惡勢力「獎鬥人」進行「秘密東西」交易。據小新的好朋友正男(別號:「無間正男」)所說,自從美冴媽媽縮減早餐改買「特級烤肉」晚餐的那一刻開始,他們一家就變了,爸爸變成「臭狐戰士」,媽媽化成「電波少女」,小新聯同妹妹小葵、小狗小白組成「搗蛋兵團」。另據警方線人指出小新一家正合力避開警民耳目,潛入獎門人的總部。但在另一方面,小新一家的鄰居卻相信他們是無辜的。究竟誰是誰非?小新一家真的與邪惡勢力交易?還是另有冤情?