在公元200X年,由于网络科技日新月异,人类已经进入一个全新网络时代。每个人都会随身携带类似小型个人计算机的PET,其中安装称之为“网络领航员”的人工智能计算机。PET及网络领航员的发明为人类生活带来许多好处,但是网络黑客、病毒传播及高科技犯罪也成为日益严重的问题。光热斗是个国小5年级的小学生,住在秋原镇。在他升上5年级的时候,父亲设计了一个个人网络领航员─洛克人作为礼物,于是他与学校的好朋友们组成网络领航员团队,专门解决网络上发生的问题,结果发现,这些神秘犯罪的始作俑者就是邪恶组织WWW。为了阻止WWW
十多年前一只拥有巨大威力的妖兽“九尾妖狐”袭击了木叶忍者村,当时的第四代火影拼尽全力,以自己的生命为代价将“九尾妖狐”封印在了刚出生的鸣人身上。木叶村终于恢复了平静,但村民们却把鸣人当成像“九尾妖狐”那样的怪物看待,所有人都疏远他。鸣人自小就孤苦无依,一晃十多年过去了,少年鸣人考入了木叶村的忍者学校,结识了好朋友佐助和小樱。佐助是宇智波家族的传人之一,当他还是小孩的时候他的哥哥——一个已经拥有高超忍术的忍者将他们家族的人都杀死了,然后投靠了一直想将木叶村毁灭的大蛇丸,佐助自小就发誓要超越哥哥,为家族报仇。