《神奇宝贝超世代》(Pokémon Advanced Generation)共分为芳缘地区丰缘联盟及关都地区对战开拓区两篇,《神奇宝贝超世代》和前面的剧情不一样的就是,故事变成了两个主线,小智为了参加丰缘联盟,努力挑战道馆,丰缘联盟结束后,则改挑战故乡关都地区新设的对战开拓区,而小遥则以成为协调训练家努力,挑战各地的华丽大赛,取得优胜缎带勋章,好参加大型庆典,两人都为了达成各自的目标,与神奇宝贝一同奋斗。 这个星球上生活着不可思议的生物神奇宝贝。现在开始讲述少年小智和神奇宝贝们的相遇、冒险和战斗经历