马如龙为重案组督察。在一次同学聚会上巧遇暗恋多年的julia，席问众同学均各有所成，尤其是马友友已贵为测量师，而且还是julia的上司，如龙妒忌万分。马友友回家，不幸遇上冷面杀手Peter，并被其所杀，julia目睹过程，重案组接手此案。上司鲍鱼刷怀疑马友友之死因与Peter收黑钱有关，于是马如龙假扮工务局高官与邓周旋，搜集刘邓犯罪证据。邓挟持郑的表妹作要胁，幸得julia相助而将邓拘捕。
富商施头（王青 饰）其貌不扬，在某次名流聚会上被美女Lychee（利智 饰）戏弄，怀恨在心，并扬言报复。偶然机会，施头遇见来自大陆的前进发（周润发 饰）、高佬伟（曾志伟 饰）和傻鸡（成奎安 饰）。他灵机一动，希望让前进发假扮贵公子勾引Lychee，并请出仪表教练Anita（梅艳芳 饰）对其进行贵族礼仪训练。苦于在香港不见出头之日，三人一口应承下来。经过一段时间的魔鬼训练，前进发在随后举行的印度弱智儿童基金晚宴上大出风头，将Lychee在内的一干美女迷得神魂颠倒，甚至连亲手将其调教出来的Anita也不能自已
富商林醒得知自己身患绝症时日无多，于是派人寻找自己失散多年的孙子林天赐。林醒告诉林天赐，如果他能够在一个月之内觅结婚，便可以继承自己的遗产，若非如此，这笔财产将归于林醒的侄子罗伯特。眼看着一个月的期限将至，林天赐在快餐店里邂逅了名为乐小小的女子。得知这一情况，罗伯特坐不住了，他派出了玛丽琳诱惑勾引林天赐，成功的离间了前者和乐小小的感情。哪知道玛丽琳贪图遗产，竟然决定真的和林天赐结婚。
抗日战争时期，日方搜刮中国大批文物，而这批文物的藏宝图胶片被台湾间谍“宝岛七十二号”（叶子楣 饰）得到，日本间谍猪木（葛民辉 饰）与马场（林海峰 饰）赶赴香港，将七十二号击伤，谁知却惊动了正在表演
神勇重案组督察李修遭匪首郭岭南报复，伤妻丧儿，李从狱中引出岭南之旧伙伴朱宇作线眼，设计辑捕岭南。 朱宇起初虚与委蛇，一面假意协助修，实则暗中安排起回赃款与爱侣莲娜远走高飞，并导至修失职被扣押。最
20世纪末，杀手组织“八百龙”做大，首领泪七龙面对季秋堂（刘洵 饰）的叛变不敌，遂率手下前往莫斯科，寻找退出江湖的联络员“桌球”，以图平叛。桌球长居北方，收养一子一女姚龙（许冠杰 饰）、叶慕美（张曼玉 饰），由于不敌泪七龙、季秋堂两方杀手，桌球选择与泪七龙合作，将姚龙诱入敌手。 泪七龙为清除季秋堂，严酷训练资质优异的姚龙，姚龙失忆后任其摆布，幸有泪七龙小女紫炎珠（李丽珍 饰）调笑陪伴。姚龙经训练成为代号“自由人”的杀戮机器，为泪七龙铲除了季秋堂势力，期间为苦苦寻找他的叶慕美发现，但两人无法相认。季秋堂
郑裕玲和尔冬升饰演一对准备结婚之同居男女，但由于某种原因，其原有之新居未能入住，因此便租住其好友郑丹瑞祖父之古老大屋内。利智及唐丽球本是郑丹瑞祖父卢海鹏之黑市夫人及侍婢，当二人死后其鬼魂仍留在大屋内等待卢之回来。人，鬼住在一起，便发生连串笑话。最后，更出现一幕诙谐捉鬼……
金刚（许冠杰饰）与光头佬（麦嘉饰）在一次泰国的任务中不欢而散，自此分道扬镳各奔前程……时间一晃三年，国宝兵马俑与秦皇宝剑在赴港展出的路上被白手套一伙施调包计窃走，自称“新最佳拍档”的飞贼姐弟（利智&张国荣饰）再由白手套手中夺走宝剑，并高调登报嫁祸于最佳拍档。一时间，大陆方面派出的中国蓝波（李元霸饰）与白手套等人均认为退出江湖的最佳拍档是夺剑人，对金刚和光头佬展开连番追捕。最终两个老搭档终于澄清误会，联合飞贼姐弟接受大陆方面的艰苦训练，以期能够为保护国宝而战……本片是《最佳拍档》系列
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